CFR克卢日足球俱乐部成立于1907年;当时的克卢日市还是奥匈帝国的一部分。俱乐部原来的匈牙利语名称是“铁路工人队”。1907至1910年克卢日参加了克卢日-纳波卡地区联赛然而并没有取得引人注目的成绩。
1910年球队赢得了新创办的特兰西瓦尼亚联赛冠军并在1911-1914年连续四次获得亚军。这项赛事随后由于第一次世界大战而被迫中断。战后特兰西瓦尼亚成了罗马尼亚的一部分因此俱乐部更名为CFR克卢日保持和国家铁路的关系并在1918-1919和1919-1920两个赛季中获得地区联赛的冠军头衔。
1936年克卢日被降入第三级别联赛罗马尼亚第三级别联赛由于二战而解散克卢日参加了匈牙利第二级别联赛并升入顶级联赛。1941-1944年间克卢日参加了匈牙利顶级联赛。二战结束后克卢日在罗马尼亚第三级别联赛中打了一个赛季并成功升级。1946-1947赛季克卢日与当地另一家俱乐部“Ferar Cluj”合并并首次参加了顶级联赛。遗憾的是他们在顶级联赛中只打了两年就遭降级并且之后的20年都一直未能升级。
1969年夏天克卢日在教练康斯坦丁·勒杜列斯库博士的带领下打进顶级联赛。勒杜莱斯库出生于罗马尼亚南方但成长于特兰西瓦尼亚地区。在成为教练之前他曾经在20世纪40年代效力过CFR克卢日以及当地另一家知名球队克卢日大学队。1990年克卢日遭受财政危机多次濒临破产。
2002年1月俱乐部换了新老板2004年球队的表现近乎完美他们重返阔别28年之久的顶级联赛。2005年夏天CFR克卢日发生了非凡的变化。他们首次杀入欧洲赛场参加了国际托托杯。2007-08赛季更是取得了惊人的双冠王成绩。 罗甲冠军:2007-08赛季
罗杯冠军:2007-08赛季2008-09赛季
罗超级杯冠军:2009年